dbacp03299
General Description
Peptide name : Histidine-rich glycoprotein
Source/Organism : Human
Linear/Cyclic : Not found
Chirality : Not found
Sequence Information
Sequence : MKALIAALLLITLQYSCAVSPTDCSAVEPEAEKALDLINKRRRDGYLFQLLRIADAHLDRVENTTVYYLVLDVQESDCSVLSRKYWNDCEPPDSRRPSEIVIGQCKVIATRHSHESQDLRVIDFNCTTSSVSSALANTKDSPVLIDFFEDTERYRKQANKALEKYKEENDDFASFRVDRIERVARVRGGEGTGYFVDFSVRNCPRHHFPRHPNVFGFCRADLFYDVEALDLESPKNLVINCEVFDPQEHENINGVPPHLGHPFHWGGHERSSTTKPPFKPHGSRDHHHPHKPHEHGPPPPPDERDHSHGPPLPQGPPPLLPMSCSSCQHATFGTNGAQRHSHNNNSSDLHPHKHHSHEQHPHGHHPHAHHPHEHDTHRQHPHGHHPHGHHPHGHHPHGHHPHGHHPHCHDFQDYGPCDPPPHNQGHCCHGHGPPPGHLRRRGPGKGPRPFHCRQIGSVYRLPPLRKGEVLPLPEANFPSFPLPHHKHPLKPDNQPFPQSVSESCPGKFKSGFPQVSMFFTHTFPK
Peptide length: 525
C-terminal modification: Not found
N-terminal modification : Not found
Non-natural peptide information: None
Activity Information
Assay type : Antibody-based assay
Assay time : 48h
Activity : Not found
Cell line : HepG2
Cancer type : Not specified
Other activity : Anti-angiogenic activity
Physicochemical Properties
Amino acid composition bar chart :
Molecular mass : 59577.6275 Dalton
Aliphatic index : 0.534
Instability index : 49.9452
Hydrophobicity (GRAVY) : -0.956
Isoelectric point : 7.0942
Charge (pH 7) : 1.1657
Aromaticity : 0.074
Molar extinction coefficient (cysteine, cystine): (27390, 28390)
Hydrophobic/hydrophilic ratio : 0.86170212
hydrophobic moment : -0.054
Missing amino acid : None
Most occurring amino acid : H
Most occurring amino acid frequency : 66
Least occurring amino acid : W
Least occurring amino acid frequency : 2
Structural Information
3D structure : Not Available
Secondary structure fraction (Helix, Turn, Sheet): (0.2, 0.3, 0.2)
SMILES Notation: CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@H](Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CNC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@H](Cc1c[nH]c2ccccc12)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](Cc1c[nH]cn1)NC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@H](Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H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Secondary Structure :
| Method | Prediction |
|---|---|
| GOR | HHHHHHHHHEEEEEEEEECCCCCCTTHCHHHHHHHHHHHHHHTTTCEHHHHHHHHHHHHTTTTCEEEEEEEECTTTTTHEEETTTCTTTCCCTTCCTTEEEEEHEHHHHHEHHTTTTTHEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHEETTTTTCEEEEEEEHTTCTTTTCTTCTTTTTEHHTTTHHHHHHHHHTCTTTTEEEEEHTCTTTTTTTTTCCTTTTCEEEETTCTTTTTCCCTCCTTTTTTTTCTTCTTTTCCCCCCTTTETTTCCCCCCCCCCCCEEEETTTTTEEEECTTHEEEETTTTTTTHHHHTHHTHTTCTTTTCTTTTCTTTHHHHTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTCCCTTTCCCCCCCTTTTTEEEETTCCCCCCEEETCTTCCCCCEEEEETTCEECCCTTTTTCECCCTTTCCTTCTCTTTTCTCCCTCCCCCCCETTTCTTTCCTCCCTHEEEEECCCTT |
| Chou-Fasman (CF) | HHHHHHHEEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEHHHHHCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECEEEEECCCHHHHHHEEEEECEEEEEEEEHHHHHCCCCEEEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCEECCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEHHHHEEEHHHHHHHHCCCCEEEHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCC |
| Neural Network (NN) | HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCC |
| Joint/Consensus | HHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCEEEHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCEECCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCC |
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